以前、神田さんの書かれていた、「のろいの bind9 (解決編)!! の巻」とまったく同じ現象が、自宅サーバ(bind-9.2.4)でも起きていたことに気づく。
ひさびさに bind を make(setenv CFLAGS -O2; ./configure --disable-ipv6 --sysconfdir=/etc/bind --localstatedir=/var/run/bind; make)する。
VIA Edenのため、やたらと時間が掛かったものの、とりあえず、無事解決した様子。
#setenv は、CFLAGSのデフォルトが -g -O2 だったため
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